植物獲取營養和水分都是通過根部與土壤進行物質交換來完成的，因此根系的生長狀態對于植物的影響很大，研究根系形態對于農業發展而言有十分重要的意義。不過根系屬于植物“隱藏的一半”，要對其開展研究工作是有一定的難度的，而隨著科技的發展，根系分析儀被應用到了植物根系研究當中，研究人員使用它來開展工作，讓根系研究變得更輕松，也更有效率。

      傳統的根系研究采用的是挖掘法、土鉆法、土柱法、容器法、剖面法等，這些方法有一個共同的特點，那就是破壞性大、工作量大，比如說挖掘法，該方法首先需要通過整體挖掘和雙向切片的方式挖掘根系，然后再對棉花根系進行整體或部分的研究，其優點是簡單、易操作，缺點是工作量大，不能對根系進行連續觀察。土鉆法利用人或機械的力量驅動根鉆，從土壤中取出等體積含根的土柱，雖然取樣迅速，適用于大樣本試驗，并且對處理內其他植株的影響較小，但是缺點是對非均勻分布的根系研究時，由于取樣點的誤差會給整個試驗結果帶來較大的誤差。這些方法在進行后續根系分析的時候，都需要通過人工進行測算，非常不方便。
      但是如果使用根系分析儀的話，雖然也需要進行取樣，洗根的過程，但是在進行根系分析的過程中，可以摒棄人工測量的弊端，避免人工誤差，而且采用圖像拍攝結合分析軟件進行處理，可以在極短的時間內獲得根系的根總長、根平均直徑、根總面積、根總體積、根尖計數等重要信息，為根系分析的過程節省了不少時間，也為研究人員減輕了工作量，在開展根系研究的時候也更輕松和高效。