在水稻播種至秧田期農戶要重點防治種傳病害（惡苗病、苗稻瘟、干尖線蟲病等）、灰飛虱、一代螟蟲等。在水稻破口期要重點防治稻飛虱、稻縱卷葉螟、螟蟲、穗瘟、稻曲病等病蟲害。在水稻穗期以稻飛虱為主治對象，兼治其他病蟲害。
　　一、稻飛虱防治。農戶要增施有機肥，實行測土配方施肥，實行淺水勤灌，適時適度烤田。一季稻7月初前不用或少用化學農藥，營造稻田天敵繁衍有利條件。
　　當分蘗期百叢低齡若蟲1000頭（褐飛虱占60%以上）-1500頭（白背飛虱占60%以上），孕穗期（大肚期）至齊穗期百叢低齡若蟲1500頭（褐飛虱占60%以上）-2000頭（白背飛虱占60%以上）；齊穗期以后百叢低齡若蟲2000頭時，農戶可以選用吡蚜酮、噻嗪酮、乙蟲腈、毒死蜱、敵敵畏等進行防治。對于蟲態復雜的田塊，宜選擇兩種對路藥劑混用。在用藥時要用足藥量、對足水量（每畝60公斤）、噴準部位（稻株中、下部）、保持水層（3厘米左右水層5天），無水田塊加大用水量或用敵敵畏熏蒸。
　　二、稻縱卷葉螟防治。農戶要在水稻生長前期促進早發，中期適時適度烤田，后期控制氮肥使用。
　　在大發生年份，防治適期為卵孵高峰期，7天后再補治一次；中等發生年份，防治適期為低齡幼蟲高峰期。四（2）代稻縱卷葉螟防治可選用Bt、阿維菌素等藥劑（選用生物農藥Bt時，防治適期應掌握在卵孵高峰期）；五（3）代和六（4）代防治可選用阿維菌素、丙溴磷、氯蟲苯甲酰胺、甲維鹽和毒死蜱等。
　　三、水稻螟蟲防治。冬閑田及時翻耕灌深水并保持一周以上，適當推遲水稻播期，避開和減輕主害代的為害。合理用藥，開展性誘劑、殺蟲燈示范應用，以減少化學農藥用量。
　　二化螟一代以早稻大田和一季稻秧田為重點保護對象，在卵孵高峰期選用Bt及其復配劑或在1、2齡幼蟲高峰期選用殺蟲單防治；二代重點防治單季稻田，防治適期在卵孵高峰期，重發區域7天到10天后再補治一次，藥劑選用甲維鹽、毒死蜱、氟蟲腈、阿維菌素復配劑；三化螟一代結合防治二化螟，二代挑治枯心。當畝卵塊密度達120塊以上的田塊時，在卵孵高峰期用藥防治，藥劑選用阿維菌素復配劑、殺蟲單等；三代主治白穗，在一季稻破口期（當5-10%水稻破口露穗時）用藥防治，藥劑選用三唑磷與殺蟲單或阿維菌素復配劑。農戶特別要注意，防治過程中不同類型的農藥要交替輪換使用，以延緩抗藥性產生。施藥時田間要盡量保持淺水層。
　　四、稻瘟病防治。水稻品種在連續4-5年種植后要及時更換。水稻播種前農戶可以用25%咪鮮胺或5.5%二硫氰基甲烷2500-3000倍液浸種。農戶要注意氮磷鉀的合理配施，提倡噴施葉面肥。淺水勤灌，適時適度烤田。
　　在防治苗瘟和葉瘟時，發現中心病株即挑治或病葉率達3-5%時施藥防治1-2次。防治穗瘟，老病區感病品種要嚴格做到破口前3-5天噴藥預防，一周后再補治，藥劑可選用40%稻瘟靈、75%三環唑、枯草芽孢桿菌、春雷霉素等。
　　五、水稻條紋葉枯病防治。根據粳、糯稻重于秈稻的表現特性，省植保總站建議病害偏重發生稻區壓縮粳、糯稻，擴種秈稻或推廣種植鹽稻8號、徐稻3號、鹽粳9號、皖稻119、豐兩優1號、豐兩優4號等抗病性較好的水稻品種。在重病區提倡使用防蟲網或無紡布育秧，一季稻適當推遲播期，提倡直播，以避開一代灰飛虱成蟲遷移傳毒高峰。重病區小麥成熟收割期秧田普治灰飛虱，藥劑選用吡蚜酮或毒死蜱、仲丁威等，并視蟲情及時補治。病害常發區分別于灰飛虱第二、三代卵孵至低齡若蟲盛期防治，藥劑選用吡蚜酮或毒死蜱、仲丁威等。
　　六、稻曲病防治。農戶可以選用協優系列、D優527、秀水664等抗病品種。在水稻破口前10天第一次施藥，破口期再補治一次，藥劑可選用戊唑醇、井?蠟蚜、井?烯唑等。
　　七、水稻紋枯病防治。農戶在灌水耙田時，打撈被風吹到田邊的“浪渣”，并帶出田外集中處理，減少水稻紋枯病初始菌源。實行氮磷鉀合理配施，適時適度烤田。
　　在早稻孕穗期病叢率達20%、抽穗期病叢率達40%的田塊，中、晚稻分蘗至拔節期病叢率達20%的田塊，要及時噴藥防治，藥劑可選用24%噻呋酰胺懸浮劑（滿穗）、20%井岡霉素可濕性粉劑、5%井岡霉素水劑、12.5%井?蠟蚜水劑等，藥液要均勻噴在稻株中下部。重病田塊第一次施藥后7-10天再補治一次。