由于玉米種子貯藏中容易出現：
1.發熱。玉米是大粒大胚種子，胚占體積的30%。胚重占粒重的 10%～12%，種胚大，種子的呼吸旺盛，所以在同樣的水分和溫度下，比禾谷類種子的呼吸強度大，因而易發熱，導致種子變質。
2.酸敗。玉米種子的脂肪含量為4%～5%，而胚部占籽粒含脂肪量的77%～89%，因此，如高溫、高濕就易產生游離脂肪酸，使酸度升高，影響種子的生活力。
3.霉變。玉米種子胚部含較多的可溶性糖，而種子皮又簿。因此，易生霉，造成種子變質。
4.受凍。有時霜凍來的早。含水量過高而受凍害，影響種子的質量。

因此要貯藏好玉米種子，必須做到：
1.降低水分。玉米種子含水量低，可防止凍害，不易生蟲和霉變，還可延期保持種子的生活力。降低種于水分最有效的措施是通用。通風有兩種：一是自然通風，根據倉內外的溫、濕度，合理的啟閉門窗，利用空氣對流通風，其效果取決于內外溫差、風速、堆裝方式、堆垛大小、種子的孔隙度等等。當外溫、外濕低于倉內，且風速大、堆垛小、孔隙度大的，通風效果好。否則，效果差。二是機械通風，將外界干冷空氣吹入種堆或將種堆內的濕熱空氣吸出，降溫快、干燥種子。
2.巧貯藏。方法有兩種：（1）穗藏法，將囫圇穗貯藏起來，這有利于種子后熟和干燥，減少倉蟲和微生物的危害；但倉容利用率低。（2）粒藏法。對種子要求較嚴格，因粒藏易生蟲、霉變。一般在相對濕度80%以下，以糖藏為好，適合于農家少量貯藏。

水稻種貯藏法:
稻種有內、外稃，種堆疏松，孔隙大，易保管，但貯藏中存在易發芽問題。稻種含水量23%～25%時便發芽，而水稻產區空氣濕度較大，種子入庫水分過高，或入倉后受潮、淋雨都可發芽。

貯藏要點，因各地區的氣候、品種、收獲季節不同，采取不同的貯藏措施。單季稻和后季稻為粳稻，收獲時氣溫低，種子含水量較高。因此，其安全貯藏的關鍵是如何及時干燥稻種，使含水量降至14%以下。種子標準樣品庫就可以做到這點，其主要是研究貯藏環境對種子的壽命影響而研制，采用雙溫雙待系統，可使用種質保持在3-30年。