植物的呼吸作用是十分重要的，也是植物新陳代謝的一個重要組成部分。呼吸作用不僅是一個物質和能量的轉變過程，也是對植物形態功能的控制，其生理意義是十分強大的。呼吸作用中呼吸底物的徹底氧化要通過許多階段,這種分階段的逐步氧化有利于能量轉化為細胞可利用的形式。呼吸作用放出的能量除一部分以熱的形式散失于環境中外,其余則貯存于某些特殊類型的化學物質如ATP中。以后當ATP分解時,就把貯存的能量釋放出來,供各種生理活動使用。對于植物的呼吸作用的測定可以采用植物呼吸測定儀進行。
　　
　　植物呼吸測定儀的測定發現，植物器官建成作為一種生理過程,同樣受呼吸代謝的控制。有人用交替途徑抑制劑苯氧肪酸控制交替途徑的運行,導致了對水稻幼根生長的特異抑制,證明了水稻幼根的呼吸以抗氰交替途徑為主,幼根的生長受交替途徑控制,從而從整體水平上提供了呼吸代謝途徑控制種子萌發時器官建成的證據。
　　
　　通過植物呼吸測定儀的測定現已證明,果實成熟過程中存在著多條代謝途徑,這些途徑所占的不同比例影響著果實的成熟過程。在白蘭瓜果實中,幼果呼吸以非酵解途徑為主,并且磷酸戊糖途徑占主導地位。呼吸高峰到來時,增高的呼吸作用通過糖酵解進行,而成熟時呼吸又逐漸轉向三狡酸循環。這些表明不同代謝強度的組合搭配,似乎左右著果實的成熟進程。

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